Hồng Duy là một trong những cầu thủ có hành trình gian truân nhất ở HAGL. Mặc dù gắn với U19 Việt Nam, nhưng tiền vệ này không được đào tạo ngay từ đầu cùng những Công Phượng, Tuấn Anh ở lò JMG. Năm 2011, Hồng Duy từng giành được suất sang Học viện Aspire, nơi đàn anh Thái Sung rèn luyện.
Vì nhiều lý do, gia đình tiền vệ này đã quyết định nói không với lò đào tạo của Qatar. Sau đó, số phận đã đưa đẩy Duy đến với HAGL. Ban đầu, cầu thủ sinh năm 1996 được xếp đá ở đội Năng khiếu. Ít lâu sau, Hồng Duy được HLV Graechen đặc cách đưa vào thi đấu cùng Học viện HAGL Arsenal JMG.
Như “cá gặp nước”, tiền vệ này nhanh chóng trở thành nhân tố quan trọng của đội bóng, được gọi lên khoác áo U19 Việt Nam. Tuy nhiên kể từ lúc này, sự nghiệp của Hồng Duy lại trắc trở theo một cách khác: Anh thường xuyên bị luân chuyển giữa 2 vị trí hậu vệ và tiền vệ.
Khi đội bóng thiếu hụt lực lượng, HLV Graechen đã thử nghiệm phương án đưa Hồng Duy về đá hậu vệ trái. Khá bất ngờ khi anh lại chơi tốt ở vị trí mới. Kể từ đó, Hồng Duy trở thành người trấn giữ hành lang trái cho đội U19. Nhưng càng thi đấu với các đối thủ mạnh, điểm yếu về phòng ngự của Duy càng lộ rõ. Vốn là tiền vệ, anh vẫn giữ thói quen xử lý và tìm cách chuyền hơn là phá bóng.
Không ít trận đấu, Hồng Duy mắc sai sót dẫn đến bàn thua của đội nhà. Đến giải U21 Báo thanh niên, khi được trả về đá tiền vệ, Hồng Duy bất ngờ tỏa sáng rực rỡ trở lại. Anh liên tiếp lập công, khiến mọi hàng thủ hoang mang và cùng U19 HAGL vô địch. Đáng tiếc đến khi bước vào V-League, Hồng Duy lại bị đẩy xuống đá hậu vệ cánh một lần nữa. Cầu thủ 19 tuổi tỏ ra non nớt tại đấu trường khắc nghiệt, thua kém rõ rệt khi phải đối đầu với “Tây”.