引起阴茎疼痛的常见原因是男性生殖器感染，如在某些情况下包茎也可致勃起的阴茎疼痛，这是因为阴茎龟头因勃起而受到明显的挤压产生疼痛。另外有些男子因过于频繁手淫或动作太强烈，以致损伤阴茎造成阴茎勃起疼痛。另有一种更普遍而常见的原因也会造成阴茎勃起时疼痛—在阴茎里有结疤组织形成，阴茎勃起时会变弯曲，造成性交困难。